Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms