Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf518aB2RRF6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf518aB2RRF6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms