Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms