Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms