Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myom3A2ABU4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms