Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms