Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip6Q9Z1Y4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms