Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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