Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scnn1gQ9WU39 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms