Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms