Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms