Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnf4Q9QZS2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnf4Q9QZS2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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