Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms