Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm7Q9ESD6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms