Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wdr61Q9ERF3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms