Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snap29Q9ERB0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms