Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ndst3Q9EQH7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ndst3Q9EQH7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ndst3Q9EQH7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ndst3Q9EQH7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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