Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf1Q9DBU0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms