Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pop5Q9DB28 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pop5Q9DB28 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Pop5Q9DB28 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Pop5Q9DB28 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms