Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms