Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tmem54Q9D7S1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tmem54Q9D7S1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tmem54Q9D7S1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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