Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tmigd1Q9D7L8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tmigd1Q9D7L8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tmigd1Q9D7L8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tmigd1Q9D7L8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tmigd1Q9D7L8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tmigd1Q9D7L8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tmigd1Q9D7L8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tmigd1Q9D7L8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Tmigd1Q9D7L8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Tmigd1Q9D7L8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Tmigd1Q9D7L8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Tmigd1Q9D7L8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Tmigd1Q9D7L8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Tmigd1Q9D7L8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmigd1Q9D7L8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmigd1Q9D7L8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmigd1Q9D7L8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmigd1Q9D7L8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmigd1Q9D7L8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmigd1Q9D7L8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmigd1Q9D7L8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmigd1Q9D7L8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmigd1Q9D7L8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmigd1Q9D7L8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmigd1Q9D7L8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmigd1Q9D7L8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmigd1Q9D7L8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmigd1Q9D7L8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmigd1Q9D7L8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms