Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms