Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms