Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc81Q9D5W4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms