Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms