Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elp3Q9CZX0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elp3Q9CZX0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms