Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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