Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddx47Q9CWX9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ddx47Q9CWX9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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