Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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