Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms