Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms