Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms