Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms