Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE1

Rilpl2, RILP-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rilpl2Q99LE1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rilpl2Q99LE1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms