Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms