Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1bQ99JY6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd1bQ99JY6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms