Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms