Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn1Q922Y1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms