Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Vsx1Q91V10 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vsx1Q91V10 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vsx1Q91V10 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vsx1Q91V10 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Vsx1Q91V10 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Vsx1Q91V10 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Vsx1Q91V10 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Vsx1Q91V10 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vsx1Q91V10 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vsx1Q91V10 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vsx1Q91V10 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vsx1Q91V10 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vsx1Q91V10 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx1Q91V10 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms