Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rp1l1Q8CGM2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1l1Q8CGM2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms