Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ercc8Q8CFD5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ercc8Q8CFD5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ercc8Q8CFD5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ercc8Q8CFD5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Ercc8Q8CFD5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ercc8Q8CFD5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ercc8Q8CFD5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ercc8Q8CFD5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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