Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp27Q8CEG8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms