Protein–RNA interactions for Protein: Q8C850

Scara3, Scavenger receptor class A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara3Q8C850 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scara3Q8C850 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scara3Q8C850 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scara3Q8C850 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scara3Q8C850 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scara3Q8C850 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scara3Q8C850 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scara3Q8C850 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scara3Q8C850 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scara3Q8C850 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scara3Q8C850 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scara3Q8C850 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scara3Q8C850 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms