Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8C708 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8C708 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8C708 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8C708 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8C708 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8C708 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8C708 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8C708 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8C708 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8C708 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8C708 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8C708 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms