Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Pggt1bQ8BUY9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Pggt1bQ8BUY9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Pggt1bQ8BUY9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Pggt1bQ8BUY9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Pggt1bQ8BUY9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Pggt1bQ8BUY9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Pggt1bQ8BUY9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pggt1bQ8BUY9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms