Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrde2Q80XC6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms