Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms