Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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ScocQ78YZ6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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ScocQ78YZ6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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ScocQ78YZ6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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ScocQ78YZ6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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ScocQ78YZ6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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ScocQ78YZ6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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