Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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PdgfrlQ6PE55 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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PdgfrlQ6PE55 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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PdgfrlQ6PE55 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PdgfrlQ6PE55 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PdgfrlQ6PE55 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PdgfrlQ6PE55 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms